RNA辅助因子对不同类型的核心启动子具有特异性

2021-12-13 01:48:54 来源:

RNA辅助因子（transcriptional cofactor， COF）在增强子与组蛋白错综复杂传递调控线索，是RNA作用于和转录的基本现像物。虽然已表明某些COF比其他COF更偏好某些组蛋白一般来说，但是各有不同COF对各有不同组蛋白显示出的内在选择性的程度尚为不正确。在一项新的研究者当中，来自匈牙利维也纳生物当教育中心分子会病理学研究者所的研究者工作人员在黑腹豚鼠S2巨噬细胞当中采用测序组蛋白活性推算出来筛选23个COF作用于7.2万个候选基本组蛋白（core promoter， CP）的能力。相关研究者结果于2019年5月末15日在线发表在Nature期刊上，论文标题为“Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters”。这些研究者工作人员观察到基本组蛋白的差异作用于，这表明COF与特定一般来说的基本组蛋白错综复杂存在着各有不同的调节偏好或者说“完整性（compatibilities）”。这些系统各有不同的基本组蛋白在TATA盒、河口组蛋白积体电路（downstream promoter element， DPE）和TCT基序等未知的序列积体电路上差异性地富集，并在内源性位点上显示出各有不同的染色质特性。都有的是，这些基本组蛋白一般来说在它们的H3K4me3和H3K4me1标有上存在各有不同的相比丰度，这表明这些组蛋白词句可能会能够区分环己烷调节因子而不是组蛋白和增强子一般来说的顺式调节积体电路。这些研究者工作人员表明在人巨噬细胞和另外两种豚鼠巨噬细胞当中表明了各有不同COF-基本组蛋白完整性的存在。为此，他们推测了分别偏好TATA盒和CpG小岛组蛋白的COF。COF和基本组蛋白错综复杂的各有不同完整性能够解释各有不同的增强子如何选择性地作用于各有不同组的基因、完全一致基因内的可变组蛋白（alternative promoter）和完全一致组蛋白内的各有不同RNA在在位点。综上所述，COF-基本组蛋白完整性可能会是豚鼠和人类等各有不同种群当中各有不同RNA程序的根基。原始原文：Haberle V1， Arnold CD1， Pagani M1， et al.Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters.Nature. 2019 May 15. doi： 10.1038/s41586-019-1210-7. [Epub ahead of print]