Nat Biotechnol：研究者不能重复？可能是HeLa细胞系“变”了

HeLa细胞膜已经在世界各地的许多的实验室室培训了近70年，并且近来被认为是无限原材料的不变的大致相同细胞膜。然而，2月18日发表在《Nature Biotechnology》时尚杂志上的一项一新数据分析表明，细胞膜在并不大致相同的实验室室彼此间存在很大歧异，这引发了对细胞膜则有数据分析重复性的质疑。“我很十分高兴看到这项数据分析，但在某种涵义上我并不令人惊讶，”斯隆凯特琳结核病当中心的基因突变学家Prasad Jallepalli时说，他没有参与这项数据分析。这并不是HeLa细胞膜则有自孕育出以来第一次不止现多样化的引述：多年来，其他数据分析小组也证明了HeLa细胞膜个形体差异形体彼此间在转录和RNA暗示的显着歧异。这项最一新数据分析首次全面分析了各种HeLa个形体差异形体的基因突变个形体差异（并不大致相同批次的HeLa细胞膜则有生活在世界各地的各个的实验室室），并且首次证明基因突变关联性引发了蛋白质暗示和基因突变的转变。HeLa细胞膜“变了”？在这项数据分析当中，数据分析其他部门从6个国家的13个的实验室室收集了14份HeLa样本，并在大致相同的的实验室室条件下开展培训。他们首先二阶了基因拷贝数个形体差异，洞察了它们真核生物彼此间的显着歧异。结果辨认出，HeLa个形体差异形体彼此间，特别是CCL2和Kyoto个形体差异形体彼此间存在着巨大的关联性。进一步的分析表明，许多这些基因突变歧异产物为mRNA产生的转变，并且在较小程度上产物为蛋白质稀土元素的转变。数据分析其他部门分析报告时说，HeLa CCL2和Kyoto细胞膜则有的转录组和蛋白质组谱彼此彼此间的歧异，就像来自两种并不大致相同类型组织的肝细胞膜则有彼此间的歧异一样。HeLa个形体差异形体在培训过程当中潮湿速度也并不大致相同，一些细胞膜群需17.5时长才能有所增加，而另一些细胞膜在大致相同的培训条件下需话费超过32时长。它们对沙门氏菌感染的反应也有所并不大致相同：与其他两种比如说相对，一种比如说对感染的敏感度较低，数据分析其他部门将其归因于低水平的蛋白质酶，这种蛋白质酶在大肠杆菌离开宿主细胞膜当中起依赖性。在一项单独的的实验室当中，数据分析小组通过培训细胞膜则有三个月，来通过观察HeLa个形体差异形体的基因暗示应该会随着时长发生转变。数据分析其他部门记录了早期细胞膜和晚期细胞膜彼此间基因暗示歧异分之一6%。苏黎世联邦理工学院分子则有统生物学数据分析所的Ruedi Aebersell大学教授是该数据分析的合着者，他时说，“即使在同一个的实验室室里，这些细胞膜的歧异和转变速度也是十分无与伦比的。”他估计，如果一个数据分析生在建设项目开始时用HeLa细胞膜则有继续做了一个的实验室，并在六个月后被建议重复这个的实验室，他们似乎会得到并不大致相同的结果。关于数据分析当中的“可复制性恐慌”的讨论大多数集当中在的实验室设计、数据分析方面的缺陷，以及作为主要驱动因素的深受污染源或贴错标签的细胞膜则有。但是Aebersell认为，HeLa细胞膜则有和肝细胞膜则有的生物学歧异似乎是关键。为什么会“变”？斯坦福大学的细胞膜生物学家Tim Stearns认为有几个似乎的诱因可以解释为什么细胞膜则有在长时长培训下会发生转变。首先，HeLa细胞膜是已知真核生物不稳定的肝细胞膜，因此很似乎随时长随机突变。此外，它们还会在的实验室室当中深受到各种潮湿条件的冲击，这似乎会有鉴于此细胞膜进化不止截然不同的特点。例如，他时说，哺乳动物细胞膜的培训包括将其培训到带给一个菌落为止，从菌落当中抽取一部分细胞膜，然后将它们放在另一个菌落当中潮湿，这一过程叫继续做分裂。“每个人继续做这件事的方式都看起来并不大致相同，”他时说道。最一新这些辨认出，对于人类文明培训细胞膜的数据分析结果的解释和描绘出性有一定的涵义。Aebersell和他的助手在论文当中提不止了几个具形体的解决方案。首先，数据分析其他部门应该采用肝细胞膜则有的早期传代，并保证在同一细胞膜则有的并不大致相同样本当中重复同一细胞膜则有的的实验室。越来越重要的是，生物学家应该清楚地分析报告他们在给定的数据分析当中采用的细胞膜则有个形体差异形体。